吏部

　　吏部為管理文職官員的機關，掌品秩銓選之制，考課黜陟之方，封授策賞之典，定籍終制之法。吏部下設四司﹕明清為文選清吏司、驗封司、稽勛司和考功司。文選清吏司掌考文職之品級及開列、考授、揀選、升調、辦理月選。驗封司掌封爵、世職、恩蔭、難蔭、請封、捐封等事務。稽勛司掌文職官員守制、終養、辦理官員之出繼、入籍、復名復姓等事。考功司掌文職官之處分及議敘，辦理京察、大計。類似現在的組織部、紀委等部門。吏部尚書還被稱為天官。

　　戶部

　　戶部掌全國疆土、田地、戶籍、賦稅、俸餉及一切財政事宜。其內部辦理政務按地區分工而設司，明十三司﹕河南、山東、山西、陜西、浙江、江西、湖廣、廣東、廣西、四川、福建、云南、貴州。清增江南司，為十四司。各司除掌核本省錢糧外，亦兼管其它衙門的部分庶務，職責多有交叉。除以上各司外，清還設有掌管八旗事務的八旗俸餉處及現審處。隸于戶部的機構有:掌鑄錢的錢法堂及寶泉局;掌庫藏的戶部三庫;掌倉儲及漕務的倉場衙門。類似現在的民政部、財政部、國土局等部門。

　　禮部

　　禮部掌典禮事務與學校、科舉之事。考吉、嘉、軍、賓、兇五禮之用;管理全國學校事務及科舉考試及藩屬和外國之往來事。禮部下設四司，明清皆為﹕儀制清吏司，掌嘉禮、軍禮及管理學務、科舉考試事;祠祭清吏司，掌吉禮、兇禮事務;主客清吏司，掌賓禮及接待外賓事務;精膳清吏司，掌筵饗廩餼牲牢事務。四司之外，清設有鑄印局，掌鑄造皇帝寶印及內外官員印信。會同四譯館，掌接待各藩屬、外國貢使及翻譯等事。類似現在的教育部、文化部、外交部等部門。

　　兵部

　　明職掌全國軍衛、武官選授、簡練之政令。清職掌全國綠營兵籍及武職官員的機構。職掌內外武職官員的除授、封蔭之典，乘載、郵傳之制，甄核、簡練之方，士籍、軍實之數。兵部下設四司﹕武選清吏司，考核武職官員的品級與選補、升調、承襲、封贈諸事，并管理土司;車駕清吏司，掌全國馬政及驛傳等事;職方清吏司，掌武職官員的敘功、核過、撫恤、軍旅之簡閱、考察、巡防等事，并管理關禁與海禁;武庫清吏司，掌全國之兵籍、軍器并武科考試之事。此外，清設稽俸廳，掌稽察武職官俸;會同館，管理京師驛傳事務;捷報處，掌遞送文書。類似今天的國防部，中央軍委及其各軍事機關。

　　刑部

　　刑部為主管全國刑罰政令及審核刑名的機構，與督察院管稽察、大理寺掌重大案件的最后審理和復核，共為“三法司制”。刑部的具體職掌是﹕審定各種法律，復核各地送部的刑名案件，會同九卿審理“監候”的死刑、案件以及直接審理京畿地區的待罪以上案件。刑部的內部組織機構的設置是按省設司，明為十三司，名稱與戶部諸司同。清增加直隸、奉天、江蘇、安徽四司，為十七司。清刑部各司除分核本省刑名外，職掌他省及衙門的部分文書收發和某些日常政務。此外，清設督捕司，掌督捕旗人逃亡事;秋審處，掌核秋審、朝審各案;減等處，掌匯核各省及現審各案之遇赦減等事;提牢廳，掌管獄卒，稽察南北所監獄的罪犯，發放囚衣、囚糧及藥物等;贓罰庫，掌收放現審案內贓款及沒收各對象，并保管本部現銀及堂印;贖罰處，掌罰罪事;律例館，掌修訂法律。類似現在的司法部和公檢法部門。

　　工部

　　工部為管理全國工程事務的機關。職掌土木興建之制，器物利用之式，渠堰疏降之法，陵寢供億之典。凡全國之土木、水利工程，機器制造工程(包括軍器、軍火、軍用器物等)，礦冶、紡織等官辦工業無不綜理，并主管一部分金融貨幣和統一度量衡。明清工部下設四司﹕營繕清吏司，掌宮室官衙營造修繕;虞衡清吏司，掌制造、收發各種官用器物，主管度量衡及鑄錢;都水清吏司，掌估銷工程費用，主管制造詔冊、官書等事;屯田清吏司，掌陵寢修繕及核銷費用，支領物料及部分稅收。除四司外，清設有制造庫，掌制造皇帝車駕、冊箱、寶箱、儀仗、祭器等;節慎庫，掌收發經費款項;料估所，掌估工料之數及稽核、供銷京城各壇廟、宮殿、城垣、各部院衙署等工程。類似現在的工信部、水利部、城鄉建設部。

　　光緒三十二年，清政府宣布“仿行憲政”，將戶部改稱度支部，兵部改稱陸軍部，工部與新設之商部合并為農工商部，原來的理藩院改稱理藩部，刑部改稱法部，另增設民政部、郵傳部。將原設之太常寺、光祿寺、鴻臚寺并入禮部，禮部內部機構中添設承政、參議二廳，儀制、太常、光祿三司及禮器庫、禮學館。至宣統三年(1911)四月，清政府成立責任內閣。五月，責任內閣頒布官制，設立制誥、銓敘等局，吏部遂撤。六月，將禮部改為典禮院，成為清政府專管朝廷壇廟、陵寢之禮樂及制造典守事宜，并掌修明禮樂、更定章制的機關。六部之制，遂告變革。