朱元璋是歷史上疑心病最嚴重的皇帝，史書中曾記載因為妃子早產而懷疑自己被戴綠帽子，于是制造鐵裙懲罰寵妃致死。像朱元璋這樣性格的人必然對自己日后的墳墓多加小心，生前小心翼翼，精心策劃，生怕會被盜墓賊找到自己的墳墓，將陵墓洗劫一空。

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　　于是在朱元璋死后按照他的要求十三座棺材從皇宮十三處同時出來，每個的排場都大同小異，其目的就是迷糊盜墓賊的視線，讓他們不知道朱元璋到底被埋在哪了。而這一方法很是有效就連馬皇后都不知道朱元璋埋在哪。

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　　孝陵附近人們經常會在夜深人靜時聽到有女子傷心的嚎哭，有人認為是女鬼的聲音，對此很害怕。有些膽子大的人在好奇心的作用下在一個有女生哭泣的夜晚前去查看，原來是朱元璋的原配馬皇后因為找不到朱元璋的墓號啕大哭。由此后世也分分猜測朱元璋的尸體不在孝陵中。

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　　至于朱元璋的妃子們必定難逃殉葬下場，關于朱元璋妃子的殉葬方式史書給出兩種結果，一種是給她們用迷藥，待昏厥后剖開腦部填入水銀，如此她們便長睡不起，尸體也可千年不腐。但是這一種說法并不能成立，因為挖開的朱元璋妃子墳墓后她們早已白骨累累，并沒有所說的水銀保鮮。

　　因此，后代更傾向第二種說法，那就是讓她們上吊殉葬，而這種手法在歷朝歷代的后宮中也比較常見，因此說服力比較強。