朱允炆選擇的下葬時(shí)間失當(dāng)，成為燕王朱棣后來起兵造事，把他攆出皇宮的第一理由。
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現(xiàn)在，關(guān)于朱元璋的死亡時(shí)間，眾說紛紜。有說是洪武三十一年(1398年)閏五月初九，有說是閏五月初五，有說是閏五月十七日等。為何會有這么多種說法，表面的原因是史書上記載的模糊。如《明史 惠帝紀(jì)》只是說明朱元璋閏五月死的，而哪一天并沒有說。 但對于下葬時(shí)間倒說得很具體，可以確定是洪武三十一年閏五月十六日。
由此推斷，死后的第七天朱元璋下葬，所以當(dāng)年的閏五月初九就是死亡時(shí)間。對于朱元璋到底是哪天死的按說應(yīng)該是很清楚的事情，而史書上寫得模糊與朱允炆為掩人耳目，故意混淆是非給朱元璋選擇下葬時(shí)間相關(guān)。
的確，堂堂一位開國之君，死后幾天就下葬了，而分封在外地的王子們卻沒有趕回來明顯不正常。所以，朱棣在聽說侄兒把他老子匆匆埋了后，十分生氣。談遷的《國榷》記載，朱棣以為父親奔喪為名，要找朱允炆，這為他以后篡位找到了第一理由。
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朱允炆到底是哪一天把祖父葬了的說法很多，明人朱國楨在《皇明大政記》稱是有六月初一。《明史本紀(jì)》稱是五月十六，而《通紀(jì)》及《建文朝野類編》都記載是閏五月二十九日。徐乾學(xué)在《讀禮通考》又稱，不是死后七天下葬的，而是七個(gè)月后，理由是，朱允炆是很講禮制的皇帝，不應(yīng)那么快就把祖父給葬了。
如今史學(xué)界大多認(rèn)為，朱允炆確實(shí)是“速葬”了朱元璋。有史書上稱朱允炆敢冒天下之大不韙是因?yàn)檫@是朱元璋自己選擇的時(shí)間，而秘史更稱，朱允炆實(shí)際上在即位的前一天就把朱元璋給下葬了。原因是朱元璋擔(dān)心自己死后出亂子，留下遺言要朱允炆從速辦自己喪事的。而朱允炆除了“遵旨”也有私心——急于即位。而從天氣的角度考慮，速葬朱元璋也有道理。南京素有“火爐”之稱，閏五月時(shí)已天氣炎熱，不早埋了容易發(fā)臭。
但決定下葬后發(fā)生了什么也成為了一個(gè)謎團(tuán)。
靈異事件：在南京民間有個(gè)傳說，朱元璋下葬那天出現(xiàn)了“迷魂陣”，就是南京的十三個(gè)城門同時(shí)出殯。對此迷魂陣有史書疑是假象，因?yàn)樵岷蟛痪脗鞒鲋煸安皇窃嵩谛⒘辏?dú)葬朝天宮。而民間也有說法稱當(dāng)年孝陵內(nèi)每到夜里便傳出馬皇后的哭聲，原因是守著孤墳悲傷所致。
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但后來對于迷魂陣一說還存在著許多爭議。有人說如果葬在孝陵內(nèi)，就沒必要搞假象;有人說朱允炆不會忍心把朱元璋葬在陵外的地方;還有人說朱元璋葬在北京的萬歲山，但后來經(jīng)過考證，該說法并不可信。
數(shù)年的科學(xué)探測、考古證明明孝陵地宮確實(shí)存在，但并不能證明朱元璋的尸骨就在地宮中，真相恐怕只有等到開挖明孝陵的那一天才能得知!因此在往后相當(dāng)長的時(shí)間內(nèi)，朱元璋到底葬在哪仍將是一個(gè)謎!