慈禧死后20年，即1928年7月4日至10日，軍閥孫殿英盜掘了乾隆帝的裕陵和慈禧陵。關于慈禧的地宮的故事和慈禧遭到盜竊，一直在坊間廣為傳播，散發著陰森的氛圍。

　　當時，軍閥孫殿英以軍事演習為名封鎖了馬蘭峪，并令工兵營用火藥炸開清慈禧太后之墓，將其中珍寶洗劫一空，毀棺拋尸。慈禧遺體被拋出棺外，嘴里的寶珠被摳走，上衣也被扒光了，下體僅剩一條內褲。

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　　據流傳，剛炸開墓室時，士兵們發現葉赫那拉氏的尸體栩栩如生，遂懼之，一個曾經的仵工(以收拾尸體為營生的人)憤而曰：“我，活人也，奈何懼一死婦”，當眾淫那拉氏之尸。

　　這個荒誕不經的傳說，甚至在一些相對嚴肅的書籍上也有記載。比如民國時期的《時事白話》中說：“尸體和繡袍見風就化，頓時慈禧的面孔萎縮成骷髏狀態，那個意欲玩弄尸體的士兵就意興闌珊，停止行動了。”

　　其實最可靠的，還是孫殿英舊部的供詞，其中并未提到玩弄尸體的事，只是說當時為了將慈禧口中所含的夜明珠拿出來，便用刺刀將其頸部切開。為獲取墊棺材底的珍寶，匪兵把慈禧遺體抬出棺外，放在槨蓋上。尸體就這樣晾了將近五十天，據后來收尸者說，重新入殮時，慈禧尸體已經腐爛，臉上和全身長了一寸多長的白毛。

　　盜案發生后，溥儀派載澤、耆齡、寶熙等人到東陵進行了重新安葬。

　　載澤等人見內棺尚完好，可以繼續使用，于是命旗婦用一塊黃綢子將慈禧遺體蓋上，將一件黃緞褥鋪在遺體一側，然后慢慢翻轉尸身，正好將遺體仰臥到黃緞褥上。只見慈禧面色灰白，兩眼深陷無珠，顴骨高隆，嘴唇有傷痕。

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　　眾人幫扶著，用如意板將慈禧遺體抬入棺內。如意板未撤出。遺體上蓋上一件黃緞被，把從地宮里拾到的慈禧生前剪下的指甲和掉的牙用黃綢子包好，放在被上。載澤又將當年得到的慈禧遺物——一件黃緞袍、一件坎肩蓋在被上，蓋上棺蓋，用漆封上棺口，重殮完畢。

　　1979年2月17日，清東陵文物保管所對慈禧地宮進行了清理。因為要趕在五一節開放慈禧地宮和慈安陵地面建筑，保管所領導決定將慈禧內棺留到旅游淡季再清理。

　　1983年12月初，旅游已進入淡季。保管所領導決定清理慈禧內棺。12月6日，包清理小組打開棺蓋后，看到一件黃緞大被把棺內蓋得嚴嚴實實，被上蓋著兩件衣服。

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　　載澤等人重殮時的原狀，55年來一直沒人動過。保管所領導當即決定立即蓋上棺蓋，封閉地宮，迅速向上級匯報。1984年1月4日，國家文物局派來了幾名專家，與清東陵文物保管所組成了一個清理慈禧內棺10人小組，負責清理慈禧遺體和棺內遺物。

　　第二天，清理小組依次揭取了被上的兩件衣服，發現了包著慈禧指甲和牙齒的小黃包。當將黃緞被卷走后，慈禧的遺骸呈現在眼前，臉部及上身用黃綢包裹著，下身穿著褲子，褲子上繡滿了“壽”字，一只腳上穿著襪子。

　　遺體仰身直臥著，頭微微左偏，右手放在腹部，左臂自然地垂于身體左側，兩眼深陷成洞，腰間扎著一條絲帶。

　　遺體是完整一體，全長153厘米。清理小組用她身底下的如意板將遺體從棺中抬出，放在地宮的地面上。在棺內噴灑了防腐消毒藥液后，又將慈禧的遺體抬入棺內。這是她死后第三次被抬入這口棺中。

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　　然后將被、小黃包及兩件衣服完全按原次序、原位置放回。一切都恢復了原狀后，又往棺內噴灑了一遍藥液，蓋上棺蓋，封好棺蓋口，木工們將殘破的外槨修好后，套在了棺外。

　　如今，慈禧的遺體仍完整地躺在棺內，保留著1928年重殮時的狀態。